تشکیل کتابخانه مرکزی دانشگاه علوم پزشکی تبریز در سال ۱۳۶۶ همزمان با جدا شدن وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی از وزارت فرهنگ و آموزش عالی، و تفکيک دانشگاههای علوم پزشکی ، بطور موقت در کتابخانه دانشکده پزشکی شروع به فعاليت کرد. در ۱۳۸۰ همزمان با انتقال دانشکده پزشکی به ساختمان جديد، از کتابخانه دانشکده پزشکی تفکيک و به محل مرکز توسعه مطالعات پزشکی ( پشمينه سابق ) منتقل گرديد.
محل ساختمان اصلی کتابخانه مرکزی، زمانيکه در دانشگاه تفکيک مطالعات منطقه‌ای توسط مشاورين ايران اک انجام گرفت، محل فعلی به عنوان کتابخانه مرکزی علوم پزشکی اختصاص يافت و قرارداد آن در سال ۱۳۷۵ طبق موافقتنامه‌ای بسته شد ولی عمليات اجرائی از سال ۱۳۸۰ شروع و در سال ۱۳۸۶ خاتمه يافت. در حال حاضر کتابخانه مرکزی در بنايی به مساحت ۵۷۰۰ متر مربع فعاليت خود را شروع کرده است.
جامعه استفاده کننده شامل دانشجویان، اعضاء هیأت علمی و کارکنان دانشگاه علوم پزشکی تبریز و فرزندان کارکنان و اعضاء هیأت علمی دانشگاه علوم پزشکی تبریز می‌باشد. کتابخانه مرکزی به عنوان قلب کتابخانه‌های دانشگاه علوم پزشکی تبریز وظیفه هماهنگی و رسیدگی به کلیه امور کتابخانه‌های زیر مجموعه خود را به عهده دارد.