اولین کتابخانه دانشگاه علوم پزشکی زابل، همزمان با تاسیس دانشکده پرستاری در سال ۱۳۷۱ به عنوان یکی از کتابخانه های تابعه دانشگاه علوم پزشکی زاهدان بنام کتابخانه دانشکده پرستاری و مامایی زابل با هدف ایجاد زمینه های لازم برای ارتقاء و سطح علمی دانشجویان، دانش پژوهان فعالیت خود را آغاز کرد.
کتب مورد نیاز این دانشکده تا سال ۱۳۸۰ توسط کتابخانه مرکزی دانشگاه علوم پزشکی زاهدان خریداری و به این دانشکده ارسال می گردید و از سال ۱۳۸۱ که دانشکده از نظر مالی استقلال یافت این کتابخانه خریداری را بطور مستقل آغاز نمود. کتابخانه های دانشگاه علوم پزشکی زابل مرکب از کتابخانه مرکزی در ساختمان معاونت آموزشی و پنج کتابخانه تخصصی در دانشکده ها و بیمارستان های مختلف است و حاوی منابع چاپی و الکترونیکی معتبر می باشد.