در راستاي اهداف آموزشي و پژوهشي دانشگاه علوم پزشكي مشهد و تجهيز دانشگاه به جديدترين منابع و دستاوردهاي علمي، كتابخانه مركزي دانشگاه در شهريور ماه سال ۱۳۸۷ همزمان با هفته دولت، در مكان دانشكده پزشكي سابق (نشاني ) و دانشكده بهداشت فعلي، رسما راه اندازي شد. پيش از آن برخي از فعاليت هاي متمركز كتابخانه هاي دانشگاه در كتابخانه دانشكده پزشكي انجام مي گرفت.
هم اکنون مديريت اطلاع رساني پزشکي و منابع علمي دانشگاه در محل کتابخانه مرکزي مستقر است که در راستاي اهداف معاونت پژوهش و فناوري دانشگاه فعاليت مي کند. زيرمجموعه هاي اين مديريت عبارتند از: واحد علم سنجي؛ کتابخانه مرکزي و تامين منابع اطلاعاتي، واحد مجلات علمي و پژوهشي دانشگاه، واحد کتب و انتشارات دانشگاه.
تقويت آموزش ، پژوهش وفعاليتهاي پژوهشي دانشگاه و حمايت ازتلاشهاي دانشگاه در جهت ارتقاي سلامت ، از طريق تهيه، توسعه و تسهيل دسترسي به منابع و اطلاعات علمي مورد نياز دانشگاه و مديريت بهره برداري از اين منابع از ماموریت های این مرکز می باشد.