کتابخانه مرکزی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی بعداز تشکیل وزارت بهداشت در سال ۱۳۶۵ در محل ساختمان شماره یک دانشگاه تشکیل و در سال ۱۳۷۹ به محل فعلی واقع در طبقه همکف دانشکده پزشکی منتقل گردید.
کتابخانه مرکزی در فضایی به وسعت ۹۹۰ مترمربع شامل بخش های: مجموعه سازی و سازماندهی، مرجع، اطلاع رسانی، تامین منابع الکترونیکی، زیراکس و تکثیر و کارگاه آموزش منابع کتابخانه دیجیتال می باشد.
تقویت آموزش، پژوهش و فعالیتهای آموزشی و پژوهشی دانشگاه و حمایت از تلاشهای دانشگاه در جهت ارتقای سلامت،از طریق تهیه،توسعه و تسهیل دسترسی به منابع و اطلاعات علمی مورد نیاز جامعه دانشگاهی و مدیریت بهره برداری از منابع علمی از ماموریتهای کتابخانه مرکزی و مدیریت منابع علمی است.