کتابخانه مرکزی دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز در سال ۱۳۶۶ با ۸ نفر پرسنل و ۷ بخش بشرح ذیل فعالیت خود را آغاز نمود. رئیس کتابخانه مرکزی - اموراداری - ثبت و سفارش (گشایش اعتبار اسنادی) - صدور کارت - فهرست نویسی - نشریات ادواری - میز امانت در سال ۱۳۶۹ کتابخانه مرکزی در طبقه فوقانی دانشکده پزشکی به مساحت ۲۲۰ متر مربع مستقر شد واقدام به استخدام پرسنل متخصص در رشته کتابداری نمود از جمله کتابدار و کارشناس کتابدار،کارشناس ارشد کتابداری. کتابخانه در سال ۱۳۷۷ به طبقه اول دانشکده دندانپزشکی انتقال و در سال ۱۳۸۸ به ساختمان جدید کتابخانه مرکزی منتقل شد و با ۱۵ نفر پرسنل و ۱۷ بخش به فعالیت خود ادامه می دهد.
ریاست کتابخانه مرکزی - واحد هماهنگی - صدور و تمدید کارت اعضاء - تسویه حساب - مبادله کتاب - اتاق سرور - سفارشات - بخش مجلات فارسی و لاتین و اسناد - فهرست نویسی - پایان نامه ها - میز امانت - مخزن کتاب - سایت اطلاع رسانی - سرچ منابع - ثبت و آماده سازی - آرشیو مجلات - مرجع - سالن مطالعه ـ سالن مطالعه هیئت علمی