این کتابخانه در سال ۱۳۴۰ در ساختمان امام ایجاد، در سال ۱۳۴۵ گسترش و از سال ۱۳۵۴ بصورت جامع و دانشگاهی به جنب ساختمان ولیعصر عج انتقال یافت و به دنبال ساخت ساختمان مهدی کلینیک و انتقال بخش اورژانس به مکان جدید، کتابخانه از اسفند ماه سال ۱۳۹۰ به مکان جدید خود واقع در ضلع جنوبی غذاخوری، روبروی تالار امام انتقال یافته است. کتابخانه مرکزی مجتمع، علاوه بر منابع پزشکی بالغ بر۳۰۰۰ جلد کتاب عمومی در زمینه تاریخ، رمان، روانشناسی، مذهبی و .. دارا می‌باشد، که بصورت امانت در اختیار مراجعین قرار می‌دهد. لیست این کتاب‌ها از طریق نرم‌افزار تحت وب آذرسا، قابل رویت و جستجو می‌باشد. ضمنا سالن مطالعه دارای ۶۰ صندلی و تعدادی دستگاه کامپیوتر جهت جستجوی منابع علمی می‌باشد. لازم به ذکر می‌باشد، مخزن بصورت بسته اداره می‌شود.